人防內三防總箱主要控制的是通風方式和空氣質量監測。具體來說，三防總箱在人民防空工程中起著至關重要的作用，它根據外部環境的不同情況調節通風模式，確保地下空間的空氣質量，并保護人員安全。以下是其主要控制功能：

清潔式通風控制：當外界空氣未受到有毒有害物質污染時，三防總箱會調整到清潔通風模式，激活三色燈箱中的清潔燈，以提醒人們外界空氣質量良好，可以進行正常通風。

隔絕式通風控制：在外界空氣污染嚴重或存在有毒氣體威脅時，三防總箱將切換至隔絕狀態，三色燈箱中的隔絕燈會亮起。這時，通風系統會實現內部循環，防止有害氣體進入地下人防工程，以保護內部人員的健康與安全。三防總箱通過三防信號燈箱提供視覺警示，幫助監控通風狀態和空氣質量，從而采取相應的防護措施。

智能型三防控制系統：隨著科技的進步，一些三防總箱升級為智能化集成系統。這些系統能更高效地控制前端設備如三防屏、呼叫按鈕等，以應對各種緊急情況。

綜上所述，人防內三防總箱的主要作用是在可能發生化學、生物或放射性污染的情況下，控制人防工程內的通風方式，并通過信號燈箱提供重要的視覺指示和警示，確保人員的生命安全。